Lex não quer matar Batman - ele quer matar Superman.
Tudo o que Lex Luthor quer fazer em todo Batman V Superman: Amanhecer da Justiça é matar Superman, pois ele teme que um homem tão poderoso quanto Superman um dia se torne um ditador, usando seus poderes divinos. poderes para dominar o mundo.
Forçando Superman a lutar contra Batman levando Martha Kent como refém, Lex espera que Batman use a Kryptonita que ele roubou de Lex para matar Superman - o que quase acontece.
É importante notar que Lex tem atraído os dois para a batalha há algum tempo, configurando uma série de eventos que levam Bruce Wayne / Batman a chegarem à mesma conclusão que Lex - que o Super-Homem é perigoso demais para viver. .
Como tal, Batman nada mais é do que um peão no jogo que Lex Luthor está jogando.