Há muitas perguntas em 1, mas vamos em ordem:
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Seu porto de entrada para os EUA não precisa ser São Francisco se o seu visto for concedido. Você pode entrar em qualquer passagem de fronteira.
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Desde que seu visto seja válido, você poderá entrar nos EUA. Vejo: Viajar para os EUA no visto B1 sem um propósito comercial para mais informações.
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O visto de sua esposa é uma preocupação à parte e deve ser tratado como tal. Seu visto de turista (B1 ou B1 / B2) não lhe dá o direito de trazer alguém que não seja você para os Estados Unidos, então sua visita provavelmente será abordada separadamente da sua.
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Dependendo do período de validade do visto, você deve poder viajar a qualquer momento durante esse período de validade. Tenho certeza de que houve uma pergunta aqui, mas não consigo encontrá-lo no momento.