Como esse personagem poderia ter sido teleportado enquanto os escudos da Enterprise estavam em alta?

Não havia escudos disponíveis durante o transporte. A última salva fez um buraco no casco da Enterprise no convés de engenharia e esgotou o último de seu poder de escudo. O fato de a Enterprise não poder mais evitar danos ao casco implica que seu poder de escudo se foi.

Observe a renúncia da tripulação quando o transporte ocorrer. Não há nada que alguém possa fazer para impedir isso.

Quando a Enterprise diverte a ideia de outro ato de resistência, a força do escudo é medida em 6%. Nem mesmo suficiente para resistir a mais uma saraivada de qualquer coisa.

Shield caiu naquele momento.

KIRK: Damage report!

SULU: Weapons are way down. Shields are dropping.

[a second later]

DARWIN: We're defenceless, sir.

_{^{Into Darkness Transcript - Chakoteya}}

Uma versão ligeiramente diferente da troca aparece na romanização oficial do filme , presumivelmente baseada em uma versão anterior do script.

Another blast rocked the artificial gravity on the bridge. If they lost that, Kirk knew, they would be almost helpless. “Evasive maneuvers! Get us to Earth now! Full impulse! Once we cross the halfway point between home and the moon, we can—”
“Shields are gone, Captain,” Sulu broke in. “Impulse power failing! We’re losing the last of our powered forward momentum.”

...

Her eyes widened as the import of her father’s words struck home. As an all-too-familiar set of lights began to swarm her, she turned helplessly toward Kirk.
“Can we intercept their transport signal?” he called out.
“No, sir!” a tech quickly responded.

_{^{Star Trek Into Darkness - Official Novelisation}}