Você disse:
I disconnect the red, black, and the neutral from the generator to the house neutral and the transfer switch leads and I read 120 volts from the black feed to the generator neutral and 120 volts from the red feed to the generator neutral and 240 volts between the red and black generator leads as would be expected but when I measure the black generator lead to the house neutral I get 0 volts and from the red generator lead to the house neutral I get 240 volts and the red generator lead is the same one popping the 30 amp generator circuit
Se o gerador preto levar para o neutro da casa for 0 volts, então alguém os conectou em algum lugar. É por isso que o fio vermelho na casa neutra é de 240 volts.
Parece que algo está seriamente enganado aqui. Separe o que você tem e poste algumas fotos ou, melhor ainda, trace cada fio e desenhe um diagrama do que você tem e poste isso com as fotos.