A "bomba", como você chama, é chamada de rotor de tempo . Isto foi mencionado pelo menos pelo Primeiro Doctor e provavelmente algumas vezes na nova série também. Não me lembro de frases / episódios específicos o suficiente para dizer onde e quando.
A descrição do TARDIS Data Core faz com que pareça um indicador de status glorificado que significa que os motores da TARDIS estão funcionando corretamente:
The time rotor was a component in the central column of the TARDIS console. While the TARDIS was in flight, the rotor rose and fell, stopping when the TARDIS reached a destination. It was associated with the 'whooshing' noise heard when the TARDIS was in flight. The time rotor was connected to the lower engines; hence as the TARDIS moved the rotor moved accordingly. As well as signifying the TARDIS' movement, the rotor was also known to stop working when something went wrong, e.g. the rotor stopped moving as the TARDIS engines stalled. This might be rectified by thumping the console.
Quanto ao que o rotor realmente faz, a resposta é provavelmente o que um escritor decidir que faz, ou apenas sobe e desce porque é isso que faz .