Sim, mas apenas no cânon secundário.
No próprio filme (canon primário), não há ornitorrincos. Mas o romance "universo expandido" A capa de queijo fedido e outros casos dos arquivos ZPD , no qual Judy e Nick visitam a Outback Island, com temática australiana, apresenta um ornitorrinco chamado Swim de Singcor (ha ha).
Eu encontrei esta resposta pesquisando "zootopia ornitorrinco", o que me levou primeiro a esta página , confirmando que os ornitorrincos fazer aparecem em algum lugar no cânone de Zootopia, e então para esta página , que apontou me para o livro relevante.