Como você deve se lembrar, Tony já havia, alguns anos antes, praticamente bêbado, conseguiu resolver o problema principal que o Maya estava enfrentando no desenvolvimento do Extremis.
Maya acreditava que ela era totalmente fundamental para os planos de Aldrich, mas Aldrich discordou, pois acreditava que Tony seria capaz de preencher a lacuna de uma "posição de alto nível" criada por ele atirando em Maya.Há também a clara implicação (como mencionado no comentário de Andrew Thompson) para a questão de que Aldrich não está exatamente operando em níveis normais de sanidade mental e, portanto, talvez não esteja considerando as conseqüências de suas ações.