Ele claramente reconheceu o patronus de Tonks como Lupin, a quem ele não gostava intensamente. Não está claro se ele estava meramente zombando da idéia de Lupin ser o Patrono de alguém ou estava zombando da própria Tonks por se apaixonar por um lobisomem.

Quanto ao seu próprio Patrono, referindo-se a Lily, tenho certeza de que ele ficaria insultado com a sua insinuação de que isso poderia ser remotamente comparável. (Lily = perfeito, Lupin == fraco. Faz todo o sentido do ponto de vista de Snape.)

Curiosamente, quando Harry testemunha a cena, ele acha que o Patronus de Tonks é Padfoot, mas o escárnio de Snape é tão crível.

Ele disse isso porque o patrono dela correspondia a alguém que ele odiava.

Snape não estava desaprovando o fato de que seu Patrono mudou porque ela estava apaixonada. Ele estava desaprovando especificamente quem ela se apaixonou.

“He shut the gates in her face with a loud clang and tapped the chains with his wand again, so that they slithered, clinking, back into place. ‘I think you were better off with the old one,’ said Snape, the malice in his voice unmistakeable. ‘The new one looks weak.”
_{^{- Harry Potter and the Half-Blood Prince, Chapter 8 (Snape Victorious)}}

Ele não precisaria da Legilimência para descobrir o que estava acontecendo. Ele provavelmente saberia a mesma coisa que Lupin explica a Harry, que um Patrono pode mudar devido a uma agitação emocional, mesmo que ele não tenha um Patrono corpóreo antes dele ser um doe como o de Lily.

“Tonks’s Patronus has changed its form,’ he told him. ‘Snape said so, anyway. I didn’t know that could happen. Why would your Patronus change?’

Lupin took his time chewing his turkey and swallowing before saying slowly, ‘Sometimes … a great shock … an emotional upheaval …”
_{^{- Harry Potter and the Half-Blood Prince, Chapter 16 (A Very Frosty Christmas)}}

Depois de ver que seu novo Patronus era um wolf , não é um salto muito lógico para conectá-lo com Lupin, o lobisomem. Além disso, ele poderia ter visto o Patrono de Lupin e reconhecido que Tonks o correspondia. Também é possível que Snape possa ter ouvido sobre seus sentimentos por Lupin de alguma forma - os pais Weasley certamente pareciam saber.

Harry suspeitou que Tonks estivesse apaixonado, e não só ele não era um Legilimens, ele nem era particularmente observador. Mesmo que Snape conseguisse entender completamente errado, como Harry fez, ele poderia ter pensado que era Sirius, que ele também odiava.

“You don’t think she can have been … you know … in love with Sirius?’ Hermione stared at him.

‘What on earth makes you say that?’

‘I dunno,’ said Harry, shrugging, ‘but she was nearly crying when I mentioned his name … and her Patronus is a big four-legged thing now … I wondered whether it hadn’t become … you know … him.”
_{^{- Harry Potter and the Half-Blood Prince, Chapter 21 (The Unknowable Room)}}