Pelo que eu posso dizer, o navio e a população são reais;
1) No episódio seguinte, o Capitão Kirk e sua tripulação são transportados para um mundo virtual povoado por "formas cúbicas sólidas flutuando em um vazio". Apesar da evidente tentativa da Brassica de apresentar isso como uma realidade, um simples escaneamento tricorder revela que esta é uma ilusão facilmente detectável. Em comparação, a Compassion é varrida repetidamente de dentro para fora (por Spock) e, embora os principais scanners da Enterprise pareçam estar "funcionando mal", não há razão para pensar que a nave não é real.
2) No final do episódio, o Capitão Kirk e Klarr usam um portal dimensional para se deslocar da Compaixão para os Brassicanos. Uma vez que eles entraram, o navio parece persistir. Novamente, se foi apenas uma ilusão, não há razão para que simplesmente não desapareça.
3) McCoy detecta que o navio é povoado por alienígenas humanóides, mas também por " vida vegetal semi-inteligente " do Sistema Algol. Dado que os Brassicanos também são baseados em vegetais, meu palpite é que o navio em si foi construído pelos Brassicanos, mas está repleto da população "rejeitada" de outra sociedade que eles testaram.