Não, ele quase certamente não sabe
O dub inglês saiu desde que esta pergunta foi feita pela primeira vez. A palavra que ele usa em seu lugar é "bug-a-boo". Então, ou a tradução do fã era ruim, o termo significava algo diferente, ou os criadores queriam evitar a implicação (seja verdadeira ou falsa) de que ele já conhece sua identidade.
Mas, na verdade, temos evidências mais recentes e conclusivas de que ele não sabe. Em A Coruja Negra (2ª temporada, episódio 7), ambas as personagens fecham os olhos quando tiram as suas Miraculosas para dar às Trevas. Coruja. Seus Kwami se vêem e identidades de seus parceiros e parecem surpresos, mas se recusam a dizer qualquer coisa.
Dado que estamos certos de que Adrien também não sabia desde Lady Wifi (episódio da 1ª temporada 7) onde ele foi tentado a ver Joaninha detransformada no armário, mas fecha a porta, ele teria que ter descoberto algum tempo depois, do qual há pouca indicação. Todas as outras implicações também apontam para nenhum deles saber (ele gosta de Joaninha, mas não persegue Marinette, por exemplo), então seria preciso uma prova muito mais conclusiva para acreditar que ele sabe que os dois são os mesmos.