O nível atômico refere-se às partes de um átomo - prótons, nêutrons, ect. É o nível em que os átomos são colocados juntos, não o nível em que eles se conectam. Subatomic seria o nível abaixo disso - Quarks et cetera. O que Kes está dizendo é que ela pode ver BEYOND Quarks em um nível ainda mais refinado de detalhes.
... Ou pelo menos, isso é provavelmente o que os escritores pretendiam - avanços na compreensão do Nível Subnuclear levaram a uma classificação separada para partículas naquela área, então o que provavelmente aconteceu aqui é um mal-entendido por parte do escritor sobre o que "Subatomic" realmente significava.