Não tenho certeza se isso funcionaria muito bem. 5e trata bônus de armadura e armadura de maneira muito diferente de 3.5. Como 5e usa uma escala limitada para ACs e DCs, a CA em 5e geralmente fica entre 10 e 25, enquanto na 3.5e você pode ver ACs subindo para mais de 30 em níveis intermediários. Se você fizer essa alteração, isso afetará bastante a dificuldade, tornando cada encontro mais fácil para os PJs, que agora são muito mais difíceis de acertar. Quanto à redução de dano, o 5e não possui um "DR mechanic" da mesma maneira que o 3.5, e os métodos de redução do dano recebido são muito limitados em comparação com a relativa onipresença do DR como uma estatística no 3.5e. Eu não tenho certeza exatamente como você traduziria armadura como DR para 5e, exceto que isso também perturbaria muito o equilíbrio do jogo.
Para responder à sua pergunta diretamente, não, você não pode abandonar uma ou ambas as regras no 5e sem interromper o equilíbrio do jogo.