Em “Phage”, por que não pegar um pulmão do alienígena que os pegou?

Isso foi abordado no programa. Além dos pulmões de Neelix serem enxertados no corpo do Vidiian, eles também foram alterados de forma a tornar impossível seu retorno, presumivelmente removendo certos fatores que resultariam em sua rejeição.

JANEWAY: I have a great sympathy for what your race has endured, but I cannot allow you to keep the organs you removed from one of our crew members. We need them back immediately.

DERETH: I'm afraid that isn't possible. I have already bio-chemically altered the air-breathing organs and grafted them into Motura's body. They are a part of him now.

_{^{Voy: Phage}}

Diálogo relevante do episódio

DERETH: We are gathering replacement organs and suitable bio-matter. It is the only way we have to fight the phage.
JANEWAY: A virus? Some kind of disease?
MOTURA: Yes, it attacked our people over two millennia ago. It consumes our bodies, destroys our genetic codes and cellular structures.
JANEWAY: So you harvest the bodies of other beings to replace your own tissues as they're consumed by this phage?
MOTURA: Our immuno-technology cannot keep up. The phage adapts. It resists all attempts to destroy it. Our society has been ravaged. Thousands die each day. There is no other way for us to survive.

Motura precisava dos dois pulmões.

A Memória Alfa diz que os Vidiians foram

forcibly removing organs from live subjects as necessary

A parte que me parece "é necessária". Isso implica que eles só pegaram o que tinham que fazer, em vez de manter órgãos à mão ou transplantar órgãos que não precisavam.

Nesse caso, eles pegaram os pulmões de Neelix. Presumivelmente, um coração livre de fagos seria útil, mas eles deixavam seu coração intacto.

Além disso, alguns membros da sociedade vidiana pareciam pouco dispostos a colher órgãos. O próprio Motura estava disposto a morrer se pudesse salvar a vida de Neelix e Danara Pel parecia ser contra a prática. Mais tarde, o Think Tank disse que Janeway não reconheceria os Vidiians sem o fago, embora Janeway tivesse visto um Vidiian saudável em forma holográfica (Pel). Isso implica que toda a sua cultura se afastou da colheita quando não era mais necessária.

Então, a resposta mais simples é que Motura precisava dos dois pulmões para sobreviver. A tripulação da Voyager não estava disposta a arriscar ou sacrificá-lo para salvar a Neelix.