Eu acho que a resposta é que foi sugerida uma supermatriz, porque é mais provável dentro do universo da matriz, considerando a lógica fria da máquina, mas a idéia foi possível abandonada.
Por que uma super matriz?
As máquinas foram capazes de derrotar Neo e Agent Smith, e sua propagação viral, ao mesmo tempo, e tomaram Zion após a batalha.
Se o objetivo final das máquinas era acabar com a conspiração. Por que eles não exterminaram todo ser humano livre. Se a razão era que as máquinas eram o "homem" de sua palavra, eu agradeço.
Mas, se houvesse uma supermatriz, eles poderiam permitir que os humanos livres continuassem vivendo, só porque eles eram mais úteis conectados à supermatriz.
A ideia da super matriz foi abandonada?
Depois de tantos anos, acho que sim. Talvez eles não pudessem explicar de uma maneira crível como os humanos livres saberiam quando definitivamente derrotassem as máquinas ... se pudesse haver uma super-matriz, por que não muitas camadas de matriz aninhadas cada uma com uma realidade simulada diferente ainda mais "real" "que o anterior.