Eu acredito que você entendeu mal os requisitos do visto. De acordo com o VFS Global :
UK residence permit (original and copy): valid for at least 90 days beyond the return date of the trip to the Schengen area.
Isso significa que você precisa que sua permissão de residência seja válida por pelo menos 90 dias após retornar da área de Schengen, em vez do caminho inverso. Então você pode ir em frente e aplicar sem esperar.