De acordo com o roteirista do filme; David N Weiss , eles voaram para lá. No dragão.
Como observa @zibbobz em seu comentário, aprendemos na cena final que Dragon também viajou para Far Far Away. É muito razoável supor que Pinóquio e outros puderam voar do Pântano de Shrek para o Far Far Away on Dragon, explicando facilmente como puderam viajar tão rapidamente.
No entanto, devo enfatizar que isso é uma suposição. Eu não localizei nenhuma prova.