Uma leitura literal da magia indica que, sim, ela pode destruir artefatos mesmo quando usada para ataques de área de efeito. Seu Mestre pode permitir que você use uma interpretação diferente - talvez você esteja deliberadamente pesquisando uma versão um pouco mais fraca do feitiço - mas isso seria um houserule.
Como diz o thewarkwanderer, os artefatos nunca são gerados aleatoriamente e devem ser extremamente raros, mesmo em jogadas de alto nível. Quando você encontrar um artefato, ele estará intimamente ligado ao enredo, e você estará bem ciente disso, então é muito improvável que você o desconecte acidentalmente.
Uma boa maneira de jogar novamente em um teste de resistência é comprar um Lâmina da sorte (presumivelmente com 0 desejos). O poder de rolar de novo é utilizável "antes que os resultados sejam revelados". Veja um exemplo de como isso funciona:
DM: "Roll a saving throw. I'm not telling you what the DC is."
YOU: "I rolled a 4, plus my mod of +11 makes 15."
<-- (You can choose to reroll at this point)
DM: "Well, the DC was 17, so the result of your saving throw is that you fail."
<-- (Now it is too late to reroll)
Para o seu caso específico, onde você sabe que o CD é 25, você pode confiar na lâmina da sorte sem problemas.
Nota: Embora o risco de se separar acidentalmente de um artefato seja baixo, o uso dessa magia vem com o risco de separar um monte de itens mágicos muito caros, que seu grupo teria ganho como pilhagem. Use com cuidado!