Isso precisaria de muito mais tempo para responder a todas as suas perguntas. Sugiro seguir os links abaixo para obter um entendimento mais completo.
Como explicado aqui , o Arquiteto reconhece para Neo que ele falhou várias vezes na criação de uma Matriz que 100% dos humanos aceitaram. A atual matriz "bem-sucedida" na qual encontramos o Neo é aceita apenas por 99% dos seres humanos. Os 1% restantes são os rebeldes encontrados em Sião, tentando derrotar as máquinas.
O problema é que, como a equipe de Zion está constantemente tentando desconectar os humanos de Matrix, essa porcentagem crescerá e causará uma queda no sistema. Para criar um equilíbrio contra essa eventualidade, o Arquiteto projetou a Matriz atual para ter o Oráculo, que revelaria A Profecia aos desertores e os enviaria na louca perseguição de encontrar Aquele que destruiria (esperançosamente) as máquinas e libertaria a humanidade. da matriz. E para citar o link acima,
Behind this door the current version of Zion is destroyed, but the One selects 23 people to build the next version. Humanity lives on in a cycle of controlled futility as the machines allow them their 'rebellion'.
Todos os 5 predecessores de Neo escolheram aquela porta, reiniciando Matrix (resultando na destruição de Zion) e começando de novo. Isso manteve o ciclo em andamento, o que manteve os 99% dos humanos indiferentes ao fato de que eles são essencialmente as baterias que mantêm as máquinas em operação.
O ponto dos filmes, encontrado aqui , é que por causa do plano bem estabelecido do Oracle, Neo escolhe o outra porta. O resultado é que as máquinas fazem um acordo com a Neo para impedir a destruição de Zion e permitir que os 1% morem fora de Matrix desde que a Neo destrua o agente Smith (a nova ameaça true tanto para humanos quanto para máquinas; Veja a subseção: The Oracle's Gamble no segundo link).
Para citar o segundo link:
Neo allows the inevitable to happen, unbalancing the equation, thereby giving the machines control of Smith through Neo's jacked in body. Neo-Smith is destroyed by the machines, then all the other Smiths are destroyed, leaving programs he previously took over lying on asphalt, 'free' again. Smith is defeated, and the Matrix reloads to version 7, with Zion persisting this time.
E na página de perguntas frequentes do site para fornecer mais explicações:
Smith has taken over Neo, fulfilling his only purpose, and unbalancing the equation. He's also directly connected to the machine mainframe through Neo's body. The machines can now delete him and revert/delete all his copies. Neo's body is carted away by the machines to assimilate his code into the mainframe. There is now a fragile peace between humans and machines. The machines, through the Architect, agree that minds that want to be freed will be. Zion will persist, with all their memories of what has happened. Humanity will begin to rebuild, freeing minds from the Matrix in manageable numbers.
E para apoiar isso, na última cena de The Matrix Revolutions, vemos The Architect falando para The Oracle sobre o jogo perigoso que ela jogou. Ela responde que "a mudança sempre é". O ciclo foi quebrado e Zion é poupado.