TLDR; Ele não pode por duas razões: ele está muito danificado e não sabia onde procurar Flynn.
Primeiro, como vemos em TRON: Uprising, Tron conta com uma câmara de cura para se manter vivo. Isso impede que ele vá em uma viagem para encontrar seu velho amigo.In TRON: Uprising, Tron resented no longer being able to fight as well as he used to, due to extensive injuries that repeatedly opened again unless he was able to constantly access a healing chamber. Despite this, Tron was a skillful and deadly fighter, able to dodge Beck's attacks with both his hands behind his back and roundly defeat one of Clu's top enforcers. It is also worth noting that Tron took a direct hit from Clu's identity disc but survived. However, his need for a constant power source and regular access to a healing chamber - without which he would derez - prevented him from being able to retake the Grid himself.
- Tron's Tron Wikia article Skills and abilities section
Segundo, Flynn se escondeu muito bem, e ele fez isso por um . Se o CLU, tendo acesso a quase todos os recursos do Grid, não o encontrou em 1.000 anos de relação de grade, quais são as chances de um programa solitário encontrá-lo? Desde Flynn pensamento Tron foi derretido, Ele não fez nenhum esforço para encontrá-lo ao seu lado.