São Barry Allen e Bruce Wayne de diferentes Universos?

Você está fazendo muitas suposições aqui. Para deixar claro, existem dois universos principais.

O Arrowverse , que consiste nos programas de TV Arrow , O Flash , Legends of Tomorrow , Vixen e Supergirl (Supergirl existe em uma Terra diferente (Terra - 38) que Flash mas ainda é canon para o Arrowverse). Constantino existe na mesma terra que Flash e Arrow.

Mas o movimento é diferente e é chamado DC Extended Universe , que consiste em Homem de Aço , Batman v Superman: Dawn of Justice , Suicide Squad , Wonder Woman por enquanto e Justice League virão em seguida. No DCEU não há menção de nenhuma Supergirl ou Arrow e lá Barry Allen é uma interpretação diferente do mesmo personagem de quadrinhos.

Aqui estão algumas palavras oficiais sobre essa abordagem de manter programas de TV e filmes separados uns dos outros:

In October 2014, Warner Bros. announced the titles and release dates for nine films, along with some casting information. Also in the month, DC Comics' chief creative officer Geoff Johns explained DC's difference in approach to Marvel Studios and their cinematic universe, saying, "We look at it as the multiverse. We have our TV universe and our film universe, but they all co-exist. For us, creatively, it’s about allowing everyone to make the best possible product, to tell the best story, to do the best world. Everyone has a vision and you really want to let the visions shine through ... It's just a different approach. - Wikipeida

Até mesmo a segunda temporada de Supergirl vai ter seu versão própria do Superman.

Portanto, não há dois cronogramas conflitantes, mas dois universos ou cânones completamente diferentes.

Consulte aqui para o blog explicando o DC Multiverso Cinemático.

Na nota lateral, o Arrowverse mencionou superman / batman e outros super-heróis da DC da Liga da Justiça de tempos em tempos. Como Barry tem Diana (Mulher Maravilha), Hal (Lanterna Verde) e Bruce em sua discagem rápida na Terra 2

E eles mencionaram ter Aquaman na Terra 2. E a Terra um Legends of Tomorrow mencionou superman e batman em um diálogo

"I've seen men of steel die and dark knights fall.

Mas esses são todos ovos de Páscoa sem aparência real. Mas Legends of Tomorrow S02 vai ter sua própria versão da Justice Society of America

The interesting thing about season two is I think it's going to have a much, much different tone because our Legends are going to have a totally different purpose. They're actually going to have a totally different constitution. There will be new faces and new everything." The season will also introduce members of the Justice Society of America. The Society will consist of Vixen, Commander Steel, Obsidian, Stargirl and Dr. Mid-Nite. The season will also feature a version of the Legion of Doom, composed of Reverse Flash, Malcolm Merlyn, Damien Darhk, and Captain Cold - Wikipedia

Mas não tem nada a ver com filmes, já que eles são entidades separadas por enquanto. Há programa de TV Gotham também, centrado em torno da cidade de Gotham, mas não tem nada a ver com qualquer outro programa de TV ou filme ainda e trabalhar individualmente.

É sutilmente implícito que eles existem de alguma forma, em algum lugar.

Por exemplo, em The Flash , o "futuro jornal" de Wells continha um artigo sobre uma fusão entre a Queen Consolidated e a Wayne Industries. E em Legends of Tomorrow , Rip Hunter sugere (sem realmente dizer) que o motivo pelo qual Superman e Batman não estão por perto é porque Vandal Savage derrotou (e presumivelmente matou) os dois!

I have seen men of steel die and dark knights fall! Your entire 21st century world will suffer.

Existe uma versão do Batman que existe na Gotham City of Arrow / Flash Earth 1.

Em algum lugar nos primeiros episódios da primeira temporada, quando Barry está conversando com Arrow, eles mencionam Batman, não pelo nome iirc, em Gotham City.