É sempre útil, quando cozinhar, pensar sobre as diferentes maneiras como o calor está sendo transferido para sua comida. No caso de cozimento, temos (primariamente) o calor da panela para o fundo de seus biscoitos, com a convecção ocorrendo do ar quente que circula para o topo de seus biscoitos e o calor radiativo do elemento de aquecimento no forno. É mais do que provável que o elemento de aquecimento em seu forno esteja no fundo, o que está fazendo com que a panela transfira o calor para a panela mais rápido do que o ideal, fazendo com que a parte de baixo queime.
Uma maneira de atenuar isso é ajustar a distância entre os elementos de aquecimento e a panela, movendo-a para um rack mais alto ou ajustando a altura do rack. Se, no rack mais alto, você ainda estiver com a parte de baixo queimada, você pode tentar colocar uma panela vazia, caçarola, pedra de pizza, etc. para tentar bloquear um pouco do calor direto.
Alternativamente, você também pode tentar, como sugere Mosfj, aumentar a temperatura para 350F. Dependendo de quão bem-feito você gosta de seus cookies, você pode ter que estender o tempo de cozimento de um minuto ou dois para compensar.