Você escolhe.
Como você mesmo disse, a lista que apresenta suas opções tem mais elementos do que o número que eles dizem para você escolher. Rogue tem 11 opções disponíveis e você escolhe 4 delas.
A única coisa que você não pode escolher são as habilidades de fundo e algumas habilidades raciais - mas você pode fazer um plano de fundo personalizado que se encaixa no que você quer, e se você já tem uma das habilidades que você obteria o fundo, você pode escolher outra habilidade livremente.
If a character would gain the same proficiency from two different sources, he or she can choose a different proficiency of the same kind (skill or tool) instead.1
De certo modo, sua irmã não está completamente errada - o conjunto de habilidades disponíveis (para obter proficiência com) de desonestos não pode ser alterado. Como sua pergunta menciona, essas são:
Acrobatics, Athletics, Deception, Insight, Intimidation, Investigation, Perception, Performance, Persuasion, Sleight of Hand, and Stealth
O que você pode mudar, no entanto, é o subconjunto de habilidades com as quais você terá proficiência.
Além disso, algumas raças oferecem uma habilidade específica, por exemplo, os elfos recebem
Keen Senses. You have proficiency in the Perception skill.
Mas isso é o quão longe a raça Elf vai em definir quais habilidades você é proficiente - além disso, depende de sua classe e experiência. Note que outras raças, como Variant Human, podem lhe dar uma escolha de habilidade grátis também.
Sobre o folclore e predominâncias
Como você disse, na maioria das vezes, um ladino Dex vai fazer acrobacias no atletismo. Isso não significa que eles não podem fazer atletismo. Do ponto de vista da ciência, seu Mestre (ou sua mesa inteira) pode querer que você justifique suas escolhas em seu histórico, e algumas são mais fáceis de justificar do que outras, mas isso não é necessário nem forçado pelas próprias regras.
Como nota, o 5e reduziu bastante esse tipo de interação restritiva. O que quero dizer é que você pode escolher ser um Mago Malvado Anão. É comum em edições antigas ou outros sistemas terem algum tipo de restrição. Por exemplo, se você estivesse jogando Paladino, você teria que ser bem legal. Ou, se você olhar para jogos como o World of Warcraft, apenas raças específicas podem ser jogadas como algumas classes. Isso geralmente não é verdade para o 5e - você pode misturar qualquer tipo de alinhamento, classe, raça, etc. sem perder nada, apenas obtendo algumas melhorias não ideais. Isso significa que o bônus que você recebe por ser um Ladino não muda se você é um High-elf, um humano ou um Orc - o que muda é apenas o bônus que você recebe por ser um elfo alto, um humano ou um orc. / p>
1 Por Crawford , isso só se aplica a habilidades básicas que você obtém no 1º nível .
The proficiency rule for backgrounds applies when you gain your background at 1st level. It has no relevance outside that context.