Eu quase nunca vi um rolo de macarrão que não faça isso pelo menos um pouco. Minha máquina de 30 anos faz isso, assim como o meu Kitchen Aid. Eu sempre imaginei que era um efeito colateral dos rolamentos lisos (essencialmente um pedaço de metal lubrificado esfregando-se contra outro), o que acabaria por escurecer qualquer óleo destinado a lubrificá-los.
Eu fui deixado tentando evitar que a massa alcançasse a borda, pois é quando isso acontece (como você viu). Quando ele fica descolorido, a minha solução sempre foi apenas recortar ou descartar a borda onde quer que ela fique preta.
Eu não acho que você deveria estar usando a borda do rolo de massa para arrumar sua massa de qualquer maneira. Se você quiser torná-lo mais quadrado, passe a bolinha de massa, então dobre a folha resultante em três ou o que quer que seja que a faça estreitar o suficiente para se alimentar perpendicularmente à sua primeira alimentação e então a execute novamente. Se você dobrá-lo cuidadosamente e alimentá-lo corretamente, suas bordas serão bastante quadradas. Eu acho que pode até haver uma ilustração disso nas instruções para o rolo de massa Kitchen Aid. Isso requer prática, mas funciona bem.