Não, Feitiço Geminado requer duas criaturas separadas

O Feitiço Geminado metamagic (PHB, p. 102) diz:

When you cast a spell that targets only one creature and doesn’t have a range of self, you can spend a number of sorcery points equal to the spell’s level to target a second creature in range with the same spell (1 sorcery point if the spell is a cantrip).

Uma ettina é uma criatura; só porque tem duas cabeças, não conta como duas criaturas, mesmo que a criatura tenha duas cabeças, dois nomes separados e duas personalidades. RAW, Twinned Spell não permitiria que uma magia mirasse na ettina duas vezes.

Isto é ainda mais suportado pela leitura da descrição do ettin no Monster Manual (p. 132):

Dual Personality. The twin heads of an ettin are two individuals trapped in the same brutish body. Each head has its own mind, personality, and name, and possesses unique preferences and quirks.

...

When other creatures refer to an ettin, they combine its double names to form a single compound name that applies to the creature as a whole.