Dependerá potencialmente do país exato, mas a maioria dos países africanos NÃO é considerada "limpa" do ponto de vista da segurança. Isso significa que, como você suspeitou, você provavelmente precisará passar pela área de segurança de trânsito antes de entrar na área de embarque.
Dependendo da hora do dia, isso pode levar de alguns minutos a pelo menos meia hora ou mais. Se você está na classe executiva ou tem o status Star Alliance Gold, geralmente leva menos, mas mesmo isso foi um pouco de sucesso ou não.
55 minutos de um país não limpo vai ser apertado, especialmente porque muitos vôos para o aeroporto de Istambul acabam usando "portões de ônibus", onde você tem que pegar um ônibus para o terminal - adicionando mais atrasos, mesmo se o seu inbound o voo está atrasado.
Pessoalmente, eu procuraria uma conexão mais longa, se possível. Se você está indo para Londres, vale a pena considerar também aeroportos alternativos (por exemplo, Gatwick, em vez de Heathrow).
Se não houver alternativa melhor, 55 minutos é possível (eles não venderiam o ticket se não fosse), mas você corre o risco real de não fazer o seu vôo de conexão - mas pelo menos como você está em um único bilhete, será responsabilidade da Turkish Airlines colocá-lo em um vôo posterior.
Se você estiver fazendo o mesmo itinerário em sentido inverso, será um pouco diferente, já que o Reino Unido é considerado limpo, então eles permitirão que você desembarque diretamente no terminal de embarque (presumindo que você já tenha seu cartão de embarque).