Obviamente, o arco-íris é definido como o espectro de cores, pois há alguma sobreposição entre as duas paletas de cores, mas isso não significa que as pedras sejam coloridas como uma referência intencional a um arco-íris. >.
A cor das pedras não é relevante para o enredo. O enredo nunca estabeleceu cores particulares sendo necessário. De uma perspectiva em perspectiva, as pedras poderiam ter a mesma cor.
Mas isso não seria visualmente agradável. Ter as pedras distribuídas entre o espectro de cores indiretamente sugere que elas são um conjunto completo, além de tornar as pedras facilmente identificáveis sem precisar de alguém para sempre identificar verbalmente uma pedra.