Existem animais reais no universo Pokémon, você simplesmente não os vê com frequência porque eles não servem para lutar, e provavelmente não vivem nos mesmos habitats que os Pokémon, pois eles não teriam chance para se defender contra eles, e como os personagens principais são todos os treinadores, esse é o tipo de área em que o show é mais comum.
Há uma extensa lista de animais no universo Pokémon no Bulbapedia que inclui aparições diretas de vermes, lagostas, peixes, caranguejos, estrelas do mar, gaivotas, espadarte e camarão. Além disso, há também evidências de pessoas que mantêm animais de estimação, como latas de comida de gato, bem como personagens que mencionam conceitos que indicam a existência de animais, como 'domadores de leão' e 'ração de galinha', bem como uma cena em que Ash se veste de vaca.