A única maneira pela qual essa pergunta faz algum sentido é se o que você está realmente perguntando é "Por que os Professores Lupin e Snape não viram Harry e Hermione duas vezes no Mapa do Maroto?", então eu vou tentar responder a essa pergunta.
Sabemos que, quando em branco, o Mapa do Maroto simplesmente se assemelha a um antigo pergaminho. Também sabemos que quando o encantamento é ativado, ele mostra todos os terrenos de Hogwarts e mostra pontos rotulados com o nome da pessoa.
O "passado" (ou deveríamos dizer, presente?) Harry e Hermione estão na Casa dos Gritos, que está em Hogsmeade (não dentro do terreno de Hogwarts) e, portanto, não é mostrado no Mapa do Maroto. Nesse caso, quando Lupin e Snape estavam olhando para o mapa (ambos no escritório de Lupin), não teria havido dois conjuntos de Harry e Hermione.
Também é possível - e talvez provável - que eles simplesmente não tenham notado sua pressa.