De acordo com uma nota de rodapé em "Cain Last Stand", os Adeptas Sororitas não fazem votos de celibato (e se você acredita que mesmo parte do fanfic você pode encontrar no 1D4Chan eles fazem sexo com bastante frequência ...). Então, sim, não há razão técnica para que eles não tivessem filhos.
Você tem que entender que o culto imperial não é tão unido e monolítico como por exemplo o catolicismo (ou mesmo o cristianismo) - existem milhares de religiões diferentes com regras diferentes, cada uma tem apenas uma coisa em comum - o imperador é o principal .
Dizendo tudo isso, é muito improvável que a irmã (especialmente da ordem militante) decida ter um filho: eles são fanaticamente devotados ao Imperador - eles se chamam "Filhas do Imperador" - (ao contrário do "Noivas do Imperador" durante a Era da Apostasia) e estar grávida iria (aos seus próprios olhos) reduzir a sua utilidade, o que é claro pecado.
Mas nos ordos não-militantes, desde que isso não afete seus deveres ...