Sim, isso é comum. A carga em qualquer vigota é transportada nas superfícies superior e inferior (as flanges) da vigota. É por isso que eu faço vigas e trabalho. A malha mais fina entre as flanges serve basicamente para manter as flanges à mesma distância umas das outras. Não há carga no centro da web. Assim, o centro da viga não precisa ter a mesma largura das flanges.
O fabricante das suas vigas tem um guia para cortar buracos na vigota, indicando o tamanho dos buracos, onde os buracos podem ser localizados e o quão próximos uns dos outros e até as extremidades das vigas os buracos podem ser . Eu incluí um exemplo abaixo, mas é claro que você deve pegar o guia ou modelo para a sua marca específica de viga.
Nunca entalhe a flange superior ou inferior de uma vigota pré-fabricada. Se fizer isso, você comprometerá a viga.