Há uma pequena chance de que isso possa ser Anvil of Stars por Greg Bear. Foi publicado em 1993, não tenho certeza se isso se qualifica como as décadas desde que você leu, mas é uma passagem decente do tempo.
Mais pertinentemente, ele apresenta sobreviventes da Terra, em uma espaçonave alienígena que de fato cuida deles e pode se remodelar para se adaptar às situações. Os passageiros deste navio baseiam sua cultura em desenvolvimento em Peter Pan e se referem a eles como Wendys e Lost Boys.
Note que esta não é uma correspondência exata para a sua descrição e é por isso que eu digo slim chance ... Você menciona especificamente as crianças, mas, como eu me lembro dessa história, havia adultos referenciando Peter Pan. Você pode ler mais detalhes aqui link