Verifique as especificações do fabricante na thinset que você está usando (ou apenas ligue para o suporte técnico para verificar).
Geralmente, se a variação no piso for de 1/4 "ou mais, em geral, não é recomendável usar a argamassa thinset para fixá-la.
Mesmo que você diga que é 3/16 ", na minha opinião, seria mais fácil usar um SLC