Meu palpite é que você viu uma aeronave de grande altitude piscando suas luzes de pouso.
Luzes de aterrissagem servem a vários propósitos. Além de iluminar a superfície de aterrissagem, eles também podem ser usados para sinalizar outros planos, pois são tão brilhantes. Para experimentar como eles são brilhantes, fique perto do caminho de aproximação ou partida de um aeroporto movimentado à noite.
A razão para os pilotos piscarem as luzes de aterrissagem em seu cenário é desconhecida. Poderia estar sinalizando outro avião em um potencial curso de colisão, ou apenas uma maneira de dizer olá para outro tráfego (ei, cruzar um avião comercial está meio entediado, hein?).
Sem qualquer referência visual, julgar distâncias em um céu noturno pode ser complicado. Piscar uma luz é uma maneira conveniente de dizer "ei, eu estou aqui!" para outros planos. É provável que seu julgamento da distância do objeto voador também tenha sido prejudicado pelo ambiente noturno. A única observação confiável que eu escolheria é que você não ouviu nenhum som, o que sugere que o objeto estava muito longe.