Não, você não precisa se inscrever novamente.
O caso das letras no número do passaporte não importa.
Isso segue o padrão ICAO 9303-3 que tem isso sobre os caracteres usados na máquina Zona legível:
Printed characters are restricted to those defined in Figure 4.
A Figura 4 não possui letras maiúsculas e minúsculas separadas:
E 9303 parte 4 que fala sobre documentos de viagem exige que o número do passaporte esteja legível para a máquina zona:
Portanto, se houvesse dois passaportes com os mesmos caracteres, exceto um deles em minúsculas e outro em maiúsculas, isso não seria perceptível para qualquer leitor de máquina que fosse claramente inaceitável. Talvez você tenha visto quando o funcionário da fronteira examina seu passaporte é apenas a borda inferior que é roubada? Essa é a MRZ. Aqui está um exemplo: 