A melhor resposta aqui é que a maioria das áreas "funcionais" do DS9 são bastante compactas. DS9 não é uma nave estelar, é uma base estelar. Portanto, suas opções para transmiti-las em algum lugar são limitadas para começar. Considere este diagrama
Ops é a melhor localização do ponto de vista estratégico. Ops é onde você vai ter pessoal armado e treinado em todos os momentos. É relativamente isolado também, estando no topo do centro. Então, digamos que você tenha hostis ou infectados. Você poderia selar o deck inteiro se necessário.
A Enfermaria, em contraste, estava no Promenade (como visto em Memória Alfa )
Hostis ou infectados correria o risco de expor a maior parte da estação.
Se você os transmitiu para um compartimento de carga, provavelmente não tem pessoal (e possivelmente desarmado para inicializar). Pior, você está dando a alguém um jeito de levar os outros para a estação.