A única pessoa que sabe com certeza as identidades de TODOS os heróis é Lex Luthor, e presumivelmente ele não tem mente bastante clara para compartilhar as informações. Clark sabe quem é Batman - como isso ocorre não está claro, mas a visão de raio-x parece uma possibilidade provável. Batman claramente não sabe quem é o Super-Homem, ou ele teria dito algo ali quando se conheceram na festa de Lex. Batman tem dados sobre Flash, Aquaman e Cyborg, mas não está claro se ele ainda leu os dados na medida em que ele conhece sua identidade, mas ele claramente saberá o suficiente para contatá-los até o próximo filme.
O público em geral não tem idéia de quem eles são - certamente o governo ou os militares não.
Quanto ao Superman pode passar por Clark Kent, o mais óbvio é que existem sete bilhões de pessoas no mundo, e muitas pessoas se parecem, e nem todo mundo é essa pessoa famosa. Houve realmente um experimento feito pelo próprio Henry Cavill recentemente - ele andou pela Times Square de óculos, e ninguém o reconheceu. Isso porque não havia expectativa de vê-lo ali, então ninguém estava olhando. Provavelmente não funcionaria, digamos, na Comic-Con. Embora Hugh Jackman andasse por aí vestido como Wolverine e não fosse reconhecido.