Sim, um ser vivo pode ser transformado em uma Horcrux.

É definitivamente possível usar um ser vivo como Horcrux. O Lorde das Trevas faz isso com Nagini, e Harry sem querer ter um pedaço da alma do Lorde das Trevas mostra que os humanos, presumivelmente, podem ser transformados em Horcruxes intencionais (embora eles tenham ainda mais independência que os animais).

“The snake?’ said Harry, startled. ‘You can use animals as Horcruxes?’

‘Well, it is inadvisable to do so,’ said Dumbledore, ‘because to confide a part of your soul to something that can think and move for itself is obviously a very risky business.”
_{^{- Harry Potter and the Half-Blood Prince, Chapter 23 (Horcruxes)}}

Então, é realmente possível que alguém tenha várias almas - sua própria alma inteira e um pedaço de outra pessoa como uma Horcrux.

Mas ter um pouco da alma de outra pessoa provavelmente não pode protegê-lo.

“He took your blood believing it would strengthen him. He took into his body a tiny part of the enchantment your mother laid upon you when she died for you. His body keeps her sacrifice alive, and while that enchantment survives, so do you and so does Voldemort’s one last hope for himself.”
_{^{- Harry Potter and the Deathly Hallows, Chapter 35 (King’s Cross)}}

Se o sangue dele não estivesse externamente amarrando-o à vida no Lorde das Trevas, então a Maldição da Morte teria simplesmente matado tanto a parte da alma do Lorde das Trevas quanto o próprio Harry. Que Harry acabou "morto" o suficiente para ir a Kings Cross mostra que a maldição poderia tê-lo matado também.

Sua pergunta é baseada em uma suposição errada: que a Maldição da Morte (ou qualquer outra forma de morte) mata apenas uma alma de uma só vez, de modo que se você tiver várias almas, sobra alguma coisa.

Esta suposição está errada. Em circunstâncias normais, a Maldição da Morte teria simplesmente matado as duas almas no corpo de Harry e ele simplesmente estaria morto.

Então, sem a circunstância muito especial de ter uma parte da alma de outra pessoa em seu corpo, você não está protegido de nada.

Como outros já apontaram, não é ter uma alma adicional como uma "segunda vida" que permite a Harry sobreviver, é o fato de que Voldemort usou o sangue de Harry para sua ressurreição. Quando Harry diz a Dumbledore que o Voldemort usou seu sangue, há essa observação:

For a fleeting instant, Harry thought he saw a gleam of something like triumph in Dumbledore's eyes. (GoF)

Dumbledore depois explica que é o sangue que deixa Harry sobreviver.

His (Voldemort's) body keeps her (Lily's) sacrifice alive, and while that enchantment survives, so do you (Harry). (DH)

Mas o principal mal-entendido na pergunta "Alguém pode ter múltiplas almas?" é que você associa uma pessoa com o corpo e não com a alma. Tanto em contextos religiosos quanto em Harry Potter, a alma é a essência de uma pessoa, não do corpo. A alma é permanente, o corpo não é.

O corpo de Voldemort é destruído, então ele tenta matar Harry, mas ele sobrevive. Quando ele é ressuscitado, seu corpo é diferente e mais sinuoso do que era antes.

‘Robe me,’ ... The thin man stepped out of the cauldron, staring at Harry ... and Harry stared back into the face that had haunted his nightmares for three years. Whiter than a skull, with wide, livid scarlet eyes, and a nose that was as flat as a snake’s, with slits for nostrils ... (GoF)

Quando as pessoas morrem, um eco de sua alma pode permanecer, seja como fantasmas, ou algo mais strong no caso do Priori Incantatem.

even though the thick grey ghost of Cedric Diggory (was it a ghost? It looked so solid) emerged in its entirety from the end of Voldemort’s wand (GoF)

"No spell can reawaken the dead," said Dumbledore heavily, "All that would have happened is a kind of reverse echo. A shadow of the living Cedric would have emerged from the wand."

Então a questão seria "Um corpo pode ter múltiplas almas ao mesmo tempo?" Embora isso possa acontecer com a posse e Horcruxes, ele não fornece a proteção que você perguntou.

No futuro, bruxos e bruxas estarão cientes deste fenômeno de transferência de almas. Talvez um bruxo das trevas extremamente poderoso pudesse usar essa técnica intencionalmente para se proteger. No entanto, se isso funcionaria ou não, ainda dependeria muito de variáveis que não são compreendidas. Alguém pode transferir parte de sua alma (para o benefício do destinatário, não apenas para esconder a alma) intencionalmente? A proteção funciona contra uma maldição de matar de alguém, ou apenas do doador de alma? As respostas para essas questões cruciais não são conhecidas.