Por que Thanos foi atingido?

Eu diria que isso foi principalmente devido ao elemento surpresa e um pouco de descrença.

Neste ponto do filme, Thanos é o ser mais poderoso do universo, e ele já garantiu que ninguém poderia forjar uma arma para destruí-lo (matando todos os anões exceto um e extinguindo sua forja). Para Thanos, Thor é apenas mais um pequeno aborrecimento para acabar com seu plano final. No momento em que ele percebe que o Stormbreaker não é um machado comum, é tarde demais para mudar de tática.

Thanos não parece ser o vilão mais inteligente do MCU, nem o mais rápido. Não há Pedra do Infinito que aumente os reflexos ou torne você mais inteligente.

Só porque as duas armas são feitas do mesmo material, não significa que sejam de força / potência iguais, especialmente no universo Marvel. Diferentes técnicas em seu design, criação e encantamentos, todos parecem desempenhar um papel no poder supremo da arma. Thor e aquele que forjou a arma estão ambos convencidos de que esta é a arma mais poderosa que eles já criaram, então é lógico que não devemos compará-los em um nível material simples.

Também precisamos considerar que Thor tinha desvantagens em ambas as lutas com Hela. No começo, ele tinha o poder do martelo, mas carecia de um verdadeiro entendimento de seu próprio poder. No final, ele entendeu seu único poder, mas não tinha uma arma para canalizar esse poder. Isso também se encaixa nisso no começo de Avengers: Infinity War :

He still has that power, but no sufficient weapon, and thus loses easily to Thanos and his servants. But come the end of the movie, he has both his powers and a great weapon to focus it through, and comes out a much greater threat.

Em relação a esse hit específico, você está questionando:

The implication does seem to be that Stormbreaker combined with Thor's powers are indeed formidable enough to stand up to the power of the infinity stones, at least to some degree. Considering individual stones are capable of being destroyed from a variety of "non-infinitely powerful" means, I think it's safer to consider the stones as sources of incredible power rather than omnipotent power. That is to say, they are incredibly powerful, but not "all powerful", and can be overcome to at least an extent given other sufficiently powerful forces.

Além disso:

The stones, like any other weapon, are only as powerful as how they're used. If Thanos' goal was just using them for their unfocused power to stop Stormbreaker, and it overcame that, then that's one thing. If he had used the stones to cause the axe to unexist, or reverse time on it, would that have had an effect? Maybe, maybe not. All we know is that however he chose to act against it, it was at least more powerful than that, and thus he was hit.

Os Stones são onipotentes, mas o Gauntlet não é. Ele não estava usando todo o poder dos Stones porque isso significaria danificar o Gauntlet além do uso, impedindo-o de fazer o Snap. Observe no final que o Gauntlet parecia queimado e espancado após o Snap, mostrando assim que o Gauntlet não consegue lidar com o poder total dos Stones.

Não vamos esquecer que o Infinity Gauntlet é a mais recente iteração de um tema recorrente no MCU: as Infinity Stones precisam ser aproveitadas por meio de um dispositivo ou mídia para permanecerem seguras e utilizáveis; o cubo em que a Pedra Espacial estava, o Aether contendo a Pedra da Realidade, a bola que tinha a Pedra do Poder, o Olho de Agamotto contendo a Pedra do Tempo e a Pedra da Mente na Visão (que tem um corpo de Vibrânio). Como revelado nos primeiros filmes dos Guardiões, você precisa ser um deus para tocar em apenas um deles.

Quando o anão Eitri estava explicando sobre a arma, que seria digna de um rei, capaz de evocar o próprio bifrost (nos quadrinhos, Mijolnir é capaz disso e de abrir passagens para outras dimensões e planos), Thanos era Simplesmente ingênuo e não versado em uma arma capaz de manipular forças elementais como TEMPO e ESPAÇO, ele tentou se defender com uma explosão de energia da manopla, mas o machado simplesmente ignorou porque era PODEROSO o suficiente, e é por isso que ele conseguiu bateu no peito.

I personally believe it is because the gauntlet is limited (meaning it can >! put through only a certain amount of power, otherwise it can break). I think so, because when Thanos snapped his fingers, the gauntlet imploded (if memory serves well). So theoretically, he could "overload" the gauntlet only once. This might mean if he put through the gauntlet too much of the stones' power, the gauntlet would break before his finger-snap and the limited amount he could ouput from the gauntlet just was not enough. Which makes sense a bit, since Stormbreaker was said to be the most powerful weapon created, meaning it could have higher threshold than the gauntlet.

Mas isso é apenas uma teoria.

No entanto, a magia mais próxima que Thanos usava eram as pedras do infinito. É muito poderoso quando eles estão juntos, o que pode acabar com quem quer que seja o titular, Thanos quer, mas ele não é páreo para a magia de Hela.

Em segundo lugar, Hela está preparada para o que vem a ela quando ela enfrentou Thor e Thanos não. Assim, ele não pode parar o machado de bater nele. "Você deveria ter chegado à cabeça." Foi o que ele disse para Thor. O poderoso Stormbreaker capaz de cortar qualquer coisa, portanto, apenas o feriu gravemente, já que ele tem uma força sobre-humana.

Em vez disso, ele não perdeu tempo e terminou seu próprio plano, o que significa que é inútil para ele usar a pedra do tempo para voltar apenas para proteger e quebrar o Stormbreaker. Ele tem uma habilidade sobre-humana, capaz de se curar de qualquer maneira.

A única razão pela qual o Mjolnir é apenas para aquele que é digno é que Odin coloca um feitiço ("quem quer que possua este martelo, se ele é digno, possuirá o poder de Thor") após ele ter banido Thor para a Terra e jogou o martelo fora. Mas eu não acho que isso seja relevante, pois mesmo que tal encantamento seja lançado no Stormbreaker, ele só se tornará pesado e papel de carta se apenas o não tão digno de tocá-lo, mas nessa cena, Thor tocou o machado quando ele empurrou mais fundo no peito de Thanos.

Poderia haver uma razão inteligente e muito específica; possíveis spoilers para o próximo filme à frente:

In the comics Tanos is powerful. A lot powerful. He's nearly more powerful then most of the currently know beings in his universe, and when he has time to plan ahead he can take down even beings much more powerful than himself. Give him the Infinity Stones, and he is basically unstoppable.

So how did they manage all this power in the comics, in a way that he could be beaten by the heroes? Well...in a very smart way, actually.

The primary source of Tanos' power is his mutation, which is at the same time his biggest motivation and his greatest weakness. Without going too much in details, Tanos' mutation gave him an edge in respect to his peers but at the same time it made him a monster to their eyes, to the point that even his mother tried to kill him when he was a child. The guy has some serious issues of low self esteem, so while he searches for power he subconsciously feels at the same time unworthy of it, and in every occasion he obtains [near] omnipotence his inner doubts make so that in the end he get defeated.

In the movie, since the beginning, he has already a lot of power and could easily defeat every hero he faces, but if you notice he never really uses it. Given that nothing we have seen up to now can defeat him, especially now that he is the second most powerful entity in the entire universe (the first being God), it doesn't sounds unreasonable that the writers could have left that door opened. They even inserted a couple others hints to the comics and the way he was defeated, so...