Os phasers podem trabalhar
Sabemos que em TNG 'Descent Pt II', os dados imobilizam com sucesso o Lore usando um phaser.
mas a configuração exata é um pouco duvidosa
Em 'A Matter of Time', Rasmussen diz para Data:
RASMUSSEN: Nor does this. This phaser is set at the highest stun setting. If I'm correct, that is sufficient to immobilise even you.
( Fonte )
Isso não estabelece que ele estava necessariamente correto (se apenas Data tivesse o chip da emoção, poderíamos ter visto se ele estava com medo!)
Mas é verdade: um phaser é uma arma baseada em energia. Os dados são essencialmente um computador que funciona com energia, portanto, uma onda de energia suficiente para atordoar um humanóide provavelmente terá um impacto negativo em seu sistema.
O incidente no closet que vemos quando Data está atordoado está em 'Birthright Pt 1' quando Data é atingido por uma descarga de energia do dispositivo Gamma Quadrant, isso o imobiliza - ele começa a sonhar, mas está fisicamente imobilizado.
Então, com base nisso, eu esperaria que, provavelmente na configuração de atordoamento mais alta, sim, os dados pudessem ser imobilizados.