Primeiro de tudo você parece ter entendido errado. Ele diz a ele que conta a hora e depois diz a ele que o alarme é bem alto.
Eu tomei isso simplesmente como uma piada irônica; uma referência ao fato de que todos os gadgets da Q sempre parecem ter algum truque ou ferramenta secreta, mas que, neste caso, ele simplesmente está dando a ele um relógio. A cena toda está cheia de brincadeiras entre Bond e Q em relação a como Bond trata os brinquedos que Q lhe dá ...
I thought I told you to bring [the car] back in one piece, not to bring back just one piece
A pista que ele lhe dá de que o relógio é mais do que apenas um relógio vem quando ele o avisa sobre o alarme.
The alarm is quite loud, if you get my meaning...
Eles, então, compartilham um olhar inteligente para entender que, de fato, fazem mais do que contar o tempo e têm um dispositivo explosivo embutido. Enquanto eles podem brincar, e Q é limitado no que ele pode fornecer a Bond enquanto ele está de castigo, ele ainda tem as costas de Bond e fornece a ele um relógio explosivo.
EDITAR:
No que diz respeito aos gadgets no carro não serem úteis, o carro foi preparado para um agente diferente e obviamente um com gostos diferentes de Bond. Não me lembro dos detalhes exatos, mas há três interruptores e, quando ele os vira, cada um tem um significado alternativo, aumentando o humor do filme. Por exemplo, a opção "atmosfera" ativa "Nova York, Nova York", adicionando à "atmosfera musical", em vez de servir como um gadget possivelmente útil, como boosters nitrosos.