A chance de salvar Davros ainda não havia "acontecido"
Dê uma olhada na linha do tempo de A Christmas Carol. O médico faz uma série de coisas no passado de Kazran Sardick, eventualmente tornando-o uma pessoa mais agradável. Como todos ocorreram no passado de Sardick, eles deveriam "sempre ter acontecido", mas eles não "aconteceram" apenas quando o Doctor voltou para fazer com que eles acontecessem.
Então é só quando o Doctor chega ao ponto na linha do tempo do HIS, onde ele volta e faz uma coisa (como recusar-se a salvar um garoto), esse evento ocorre retroativamente na linha do tempo das pessoas afetadas.
Agora eles também fizeram momentos em que o Doctor conhece alguém pela "primeira vez" apenas para perceber rapidamente que a pessoa já o conheceu claramente - a Rainha Elizabeth é um bom exemplo. E se você está procurando uma explicação de por que isso funciona de uma forma às vezes, e de outra forma o resto, eu vou ter que inventar algo.