Ter as conexões da bobina cruzadas diminuirá a eficiência do sistema. Na pior das hipóteses, seria melhor desligar a parte solar do sistema do que tê-la como instalada!
Em um trocador de calor como este, você quer que o fluido de saída seja o mais frio possível. Por esta razão, você quer que saia do fundo do tanque, onde a água é mais fria.
No seu caso, pode ser tão ruim que o tanque de água quente esteja aquecendo o fluido acima da temperatura de entrada e que o sistema solar esteja realmente removendo o calor do tanque de água quente. Mesmo que não seja tão ruim, definitivamente não é bom.
Para mais informações, consulte os trocadores de calor de contra-fluxo.
Eu não sei o que causaria a queda de pressão, mas eu concordo com você que parece que seu ar separado não foi instalado de acordo com o manual.