Eu acredito que a resposta depende de como o holodeck é programado.
MAS existe um exemplo clássico de a água ser "real", por isso é certamente um dos resultados possíveis com a programação certa:
Em "Encounter at Farpoint", o Wesley Crusher cai um pouco de água (um rio IIRC) enquanto está no holodeck, e sai do holodeck mais tarde enquanto ainda está molhado.Eu até encontrei uma captura de tela (pesquisa de imagens do Google)
Um segundo exemplo frequentemente citado é um pedaço de papel mantido por Data em "Elementary, Dear Data":
Curiosamente, isso parece ser um BUG em vez de um recurso (por exemplo, contrário ao entendimento canônico da tecnologia holodeck). O artigo do Wiki Holodeck tem isto a dizer:
Matter created on the holodeck ("holomatter") requires the holoemitters to remain stable and will quickly disintegrate if it is removed from the holodeck without a mobile emitter to sustain it, although this principle has been overlooked in some episodes.
Writer Phil Farrand has often pointed out how in many episodes matter from the holodeck that gets on a real person still exists when the real person exits the holodeck. In "Encounter at Farpoint", Wesley Crusher falls into a holodeck stream, but is still wet after exiting the holodeck. In "The Big Goodbye", Picard has lipstick on his cheek after encountering a holodeck simulation of a 20th-century woman. In "Elementary, Dear Data", Data and Geordi La Forge exit the holodeck with a piece of paper that originated in the holodeck.
This could be explained using replicated rather than holographic matter.
No entanto, essa última afirmação não é referenciada e não tenho certeza se há referências canônicas para os holodecks que incorporam a tecnologia de replicadores.