Obrigado pessoal,
Falei com um eletricista experiente que validou minhas preocupações e me deu duas opções depois que eu expliquei a ele que não estou preocupado com uma mudança de três posições.
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Substitua o disjuntor de 20A e a fiação de comutador de três vias da casa por um disjuntor de 40 ou 60A de polo duplo. Continue a usar o três condutores 100A (cabo SEC). Instale um poste de aterramento na garagem. Neste caso, o neutro e o solo poderiam estar no mesmo barramento, mas seria melhor se não estivessem.
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Substitua o disjuntor de 20A e a fiação de comutador de três vias da casa por um disjuntor de 40 ou 60A de polo duplo. Substitua o cabo SEC por um cabo SER de 4 condutores e corra meus aterramentos de volta para a casa.
pelo meu entendimento, ambas as opções estão corretas, embora a segunda possa ser um pouco mais correta e a primeira seja muito mais barata, estou pensando em seguir o primeiro caminho.