Sim, isso foi regeneração.
Não há indicação no Old Who or a nova série de que a regeneração se limita exclusivamente a ser desencadeada incontrolavelmente por eventos fatais.
Embora a regeneração geralmente seja vista no programa como um recurso de "segurança contra falhas de emergência", também é mostrado de forma muito explícita que a maioria dos Time Lords escolhe se regenerar por outros motivos que não a morte iminente. Romana é o exemplo mais proeminente, embora Borusa também venha à mente (o homem parece ter passado por corpos como algumas pessoas passam por laços).
O Doutor apenas leva uma vida tão difícil que suas regenerações ocorrem com mais violência do que a maioria dos Time Lords.
O fato de ter sido imposto a ele pelos Time Lords também não muda nada; o Conselho Superior demonstrou repetidamente ter controle sobre a tecnologia de regeneração (por exemplo, oferecendo ao Mestre um novo conjunto de regenerações se ele os ajudasse a Os cinco médicos) Não há razão para supor que o processo usado para transformar o Segundo Médico no Terceiro não tenha sido regeneração; de fato, seu diálogo nessa cena deixa claro que o processo é idêntico ao que transformou o Primeiro em Segundo (embora "regeneração" ainda não fosse realmente um termo usado pelo programa).