Eu não entendo muito bem os problemas respiratórios que o Superman teve na nave de Zod. Especificamente no contexto do fato de que ele não precisa estritamente respirar para permanecer vivo. Isso é mostrado quando eles estavam no satélite, ou Superman permanecendo submerso debaixo d'água por um tempo indeterminado.
Então, por que ele teve problemas na nave de Zod, quando nesses outros casos ele não precisou respirar?
Esta é a maneira de Nolan de incluir a fraqueza do Super-Homem - Kryptonita. Em vez de dizer que um material de Krypton o afeta, esta é uma explicação ou um design melhor. O planeta em si é estranho para Kal, já que ele inibe a Terra há 33 anos. Então, quando o ambiente muda, ele é afetado por isso.
Respirar não era o problema, praticamente tudo é. A maneira visual de mostrar isso foi a perda de força, tosse e tropeços.
Uma explicação pode ser declarada como uma questão de adaptatividade.
Podemos supor que o Super-Homem esteve no espaço algumas vezes antes dessa luta. Mesmo que ele apenas "ganhasse" sua habilidade de voo, ele ainda estava acostumado com a falta de atmosfera no espaço antes das lutas.
Flash à frente da nave de Zod, onde a atmosfera é a réplica exata de Krypton, algo que Kal'El obviamente não está acostumado e aparentemente está dificultando muito a fisiologia dos kryptonianos. Kal, não estar acostumado a essa atmosfera, assim como seu efeito repentino e prejudicial sobre ele, causa uma leve reação que não se mistura bem por algum tempo.Eu imaginei isso de forma muito simples, se a atmosfera na Terra é muito mais rica que a de Kryton (e lhe concede seus poderes) ele está adaptado para estar acostumado com isso. No entanto, se você pegá-lo e colocá-lo de volta em Krypton, ele não estaria acostumado a ter tão pouco sustento do ar.
Considere a doença da altitude, muitos atletas treinam em altas altitudes para poder explorar o oxigênio extra quando correm ao nível do mar. O super-homem está acostumado a treinar no nível do mar, então se você levá-lo ao topo de uma montanha, há muito menos oxigênio (ou do que ele está tirando o poder) do que ele está acostumado.
Eventualmente se adapta, mas leva um pouco de tempo e ele não tem seus poderes.
De acordo com a comparação entre as condições kryptoniana e terrestre de Jor-El, a Terra era mais receptiva à vida e dizia-se que nutria e a estimulava. Enquanto Krypton estava "duro" na vida.
A respiração é uma parte do processo em que o corpo recebe energia para se sustentar. No caso de Kal-El, ele também tem o sol. Então ele pode sobreviver por algum tempo fora de uma atmosfera onde o sol está presente. Enquanto na nave, a atmosfera kryptoniana agia como um veneno para seu corpo, por causa de sua natureza severa.
Além disso, Kal-El mal conseguiu aceitar e compreender o imenso poder que possui devido a estar na Terra. Então, também em um nível mental, isso é algo totalmente novo para o seu corpo. Na terra, ele viveu como um superbeque, não sendo afetado por doença, cansaço e outras doenças.