O termostato deve ligar e desligar o sistema. Se você estiver tendo problemas com chamas intermitentes, poderá ter umidade na sua linha. Eu costumo instalar pernas de gotejamento após a válvula de corte antes do forno, aquecedor de água ou intervalo que retém a água. Uma perna de gotejamento é um T com uma pequena seção de tubo indo direto para baixo que é tampada. Essa perna pega ferrugem e umidade. A gota de água 1 em uma válvula de gás pode causar problemas, então eu verificaria se você tem uma perna de gotejamento e, se assim for, desligue o gás e limpe-o. Se você não instalar um. Já tive casas com problemas horríveis de umidade nas tubulações de gás e outras com quase nenhum problema. Já que você jogou todas essas partes, eu consideraria a umidade a causa possível.