Um enxame pode entrar no espaço de outras criaturas, mas qual é o tamanho desse espaço?
Uma criatura média ocupa um quadrado na grade e um quadrado na grade de batalha da edição 5 representa os pés 5. Uma criatura em um quadrado não é um cubo sólido do 5X5X5, mas um ser em movimento, esquivando-se e ameaçando. No momento, um feitiço, como Parafuso de fogo é lançado, por uma questão de narrativa, não precisa ser no momento em que um enxame está necessariamente rastejando sobre a referida criatura, mas apenas dentro do mesmo espaço para pés 5. Quem está descrevendo os resultados da ação (geralmente o Mestre) pode descrevê-lo assim:
You point your finger and concentrate on the swarm. A bolt of fire launches from your fingertip and strikes the ground where the swarm of ants seems the most dense. Roll 1d10 fire damage against the swarm.
Or
The swarm of deadly mosquitoes temporarily disengages from your friend, and you take the opportunity to quickly shoot a bolt of fire into the mass of insects hovering in the air, inches from your ally. Roll 1d10 fire damage against the swarm.
Só porque um enxame está dentro do espaço de uma criatura não significa que você precise visualizar (ou narrar) que está na criatura o tempo todo. É simplesmente na proximidade para a outra criatura, perto o suficiente para atacá-la.
Uma alternativa
Para os DMs mais vingativos por aí, você pode impor uma desvantagem na jogada de ataque contra o enxame, usar as regras de cobertura sugeridas na outra resposta ou até inspirar-se nesta parte do feitiço Fire Bolt:
A flammable object hit by this spell ignites if it isn't being worn or carried.
Certos feitiços podem ter efeitos ambientais perigosos e, ainda usando Fire Bolt como exemplo, um arbusto seco perto da criatura pode pegar fogo e representar um perigo ou talvez uma peça de sua roupa.
É importante notar que, se você for nessa direção, é a habilidade de esculpir feitiços do Assistente de Evocação encontrada na pg.117 do PHB. Permite ao mago proteger uma quantidade limitada de aliados dos efeitos de feitiços perigosos que ele / ela lança. Isso sugere, para mim, que disparar um raio mágico de fogo no espaço de seus aliados deveria ser uma coisa perigosa a fazer.
Todas essas opções, no entanto, são regras da casa e tornam o sistema mais tendencioso contra os jogadores do que o planejado pelos designers.