Causa: talvez tenha havido uma falha de usinagem em uma das placas que os impediu de se acasalar com força, ou a madeira encolheu, ou o instalador do piso ficou de ressaca. Difícil dizer.
Solução: nenhuma (a menos que você queira puxar as placas de piso e reinstalá-las). Não tente encher a fenda com massa de madeira - ela vai acabar ficando ainda pior. Você só tem que aprender a viver com isso. Lacunas nos pisos de madeira são muito comuns, e as suas realmente não são tão ruins assim.