Missy estava mentindo?

Sim.

Missy mentiu para o doutor sobre Gallifrey. Nós vemos o que ele vê quando ele vai para as coordenadas que ela forneceu a ele, e ele vê o espaço vazio.

[Atualização - janeiro de 2015] A confirmação da mentira entre The Doctor e Clara é revelada no seguinte diálogo do Especial de Natal de 2014 ("Last Christmas"):

DOCTOR - You never told me he was dead. You said he made it back.

CLARA - I lied. I lied so you'd go home to Gallifrey instead of fussing about me.

DOCTOR - I never found Gallifrey. I lied. So you'd stay with Danny.

Isso é um sim e não pergunta, o Doutor fez as coordenadas corretas dadas por Mestra / Mestre, mas Galifrey não estava lá, então isso faz a maioria das pessoas pensar que Mestra / Mestre mentiu. ERRADO! Mestra / Mestre deu ao Doutor as coordenadas corretas, mas ela nunca disse a ele em que dimensão estava. Pelo que sabemos, Galifrey poderia estar na Dimensão de Rose, mas uma questão maior é, se Mestra / Mestre voltasse através de diferentes dimensões Galifrey, não iria acontecer um rip no espaço e no tempo como na 2ª temporada onde uma batalha entre cyberman vs dalek vs. humana estava acontecendo, ou como na 4ª temporada quando Rose voltou para avisar o Doctor sobre a próxima invasão de dalek e Donna se tornou uma senhoria humana combinação e havia 2 médicos e 1 deles cometeu genicídio nos daleks, podemos nunca saber, mas tem que haver fechamento para isso na próxima temporada, onde Rose volta mais uma vez para contar ao médico sobre Galifrey e o rasgo no espaço e tempo ou o rasgo entre dimensões que é praticamente a mesma coisa.